As desvantagens

• Área especifica – Reservatórios geotérmicos utilizáveis só podem ser encontrados em certas áreas. Os lugares disponíveis podem ser em áreas protegidas silvestres como o Parque Nacional de Yellowstone nos EUA ou podem ser distantes das áreas de demanda de consumidores.
• Depleção – Reservatórios geotérmicos podem ser esgotados quando a quantidade de vapor ou água retirada é maior do que pode ser recarregado ou artificialmente re-injetado. Uma vez que está completamente esgotado, o reservatório geotérmico pode levar séculos para se recarregar.
• Emissões de ar – Pode ter sulfureto de hidrogênio, dióxido de carbono ou outras emissões tóxicas, principalmente a partir de plantas secas a vapor.
• Lixo – Com algumas plantas, sólidos e resíduos tóxicos podem ser trazidos à superfície com a água geotérmica. Pode haver dificuldade de escoamento dos resíduos e ele também pode danificar a própria unidade.